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毫無疑問，未來的癌癥治療將會根據(jù)患者特異性的生物標志物變得越來越個性化。在實現(xiàn)癌癥個性化治療的道路上，下一代測序（NGS）技術發(fā)揮著不可取代的作用。在過去的幾年里，NGS變得更加精確，它幫助研究人員和病理學家實現(xiàn)了從單基因檢測到多基因檢測的完美轉換。
NGS通過廣泛的基因篩查，預測癌癥的發(fā)病風險，幫助醫(yī)生確定癌癥不同亞型的特異性療法。從另一方面來說，NGS通過解碼不同癌癥的基因變異信息，為醫(yī)生更好的理解癌癥的發(fā)病機制提供了很大的幫助。在了解患者遺傳學信息的基礎上，他們可以從多種癌癥療法中選擇對病人最佳的治療方案。
德克薩斯大學MD安德森癌癥中心分子診斷部門主任 Rajyalakshmi Luthra 博士說：“如今，大多數(shù)的分子診斷實驗室都在通過測序技術尋找與各種疾病相關的基因或其它標志物。我們知道每個癌癥類型都可能有多個分子標記，為了更好的進行靶向治療，我們不得不尋找更多的靶標?！?/span>
NGS在癌癥治療中的現(xiàn)狀
雖然NGS技術在近些年取得了巨大的進步，但是它依然是一個相對昂貴的技術。盡管目前測幾百個基因的成本可能只相當于五年前測單個基因的成本，但是每次檢測的平均成本依然在2500-5000美元之間。出于這樣的原因，NGS的發(fā)展大部分依然局限在大型的學術醫(yī)療中心和診斷公司的實驗室中。
臨床診斷公司 BioReference Laboratories 的研發(fā)主任 Robert Daber 表示，NGS的應用仍處于初級階段，要想在使NGS使用更加廣泛，我們必須做到以下兩點：第一，它需要覆蓋更多與臨床相關的可控突變；第二，它需要使成本更加“親民”，且具有實際的檢測效果。
Luthra博士說：“三年前MD安德森癌癥中心開始使用NGS技術，我們的目標是從分子水平對腫瘤進行分析，為臨床醫(yī)生治療病人提供特異性標志物。然而，我們得到的腫瘤樣本的數(shù)量其實非常有限，因此，我們不能像以前做試驗一樣一次只檢測一個標志物?！?/span>
“其實，除了與臨床相關的標志物，那些目前被鑒定為與臨床無關的突變也一樣重要?！盌aber博士說，“可能有些突變只在極少數(shù)腫瘤（1%或1.5%）中被發(fā)現(xiàn)，但問題是，這些獨特的突變究竟會影響癌癥的發(fā)展，還是與不含這種突變的患者相差無幾。目前，我們也沒有明確的答案?！?/span>
NGS的局限性
因為NGS仍是一個非常新鮮的技術，儀器公司一直在不斷尋找改善NGS檢測方法以及他們提供的數(shù)據(jù)和信息工具的途徑。這也是很多機構不想在他們的實驗室開展NGS的原因，不斷更新的成本實在太大了。
Luthra博士說：“廠商總是在不斷努力改善他們的硬件和軟件，當然，這也是合情合理的。任何一個新的有前途的技術都需要不斷的進步。然而，在臨床實驗室中，你不可能總是回頭驗證之前的結果是否正確。在一些小型或中等規(guī)模的實驗室，他們也不可能收集到足夠的樣本來重復驗證?！?/span>
另一個在未來需要解決的限制因素是，腫瘤學家的遺傳學素養(yǎng)應該進一步提高。美國阿拉巴馬大學基因組科學Heflin中心的主任 Bruce Korf 博士說：“在基因組時代到來之前，臨床醫(yī)生需要進行大量的遺傳學信息的學習，只有真正了解了基因組在疾病發(fā)生中扮演的角色，才能在實踐中利用好它們?！?/span>
NGS在癌癥治療中的展望
當然，依據(jù)NGS技術完成臨床決策還為時尚早，但是學術醫(yī)療中心和診斷公司每天積累的數(shù)據(jù)是進一步解開疾病秘密的關鍵。Daber博士說：“NGS讓我們了解了如此多的基因，接下來我們真正需要做的是整理這些重要標志物的信息（包括檢測方法、致病機理等），IT技術也可以為我們所用?！?/span>
Luthra博士補充說：“隨著越來越多的標志物被鑒定出來，醫(yī)生可以判斷是否需要對患者進行多基因檢測。商家可以先提供具有針對性的檢測服務供一些小型的醫(yī)院選擇。如果醫(yī)院需要更多的病人基因組信息，他們再選擇更全面的檢測項目。這樣一來，NGS技術會進入更多的醫(yī)院?！?/span>
盡管實現(xiàn)這一愿望可能需要好多年，但是Luthra博士依然相信，隨著大數(shù)據(jù)的發(fā)展和進步，NGS技術必將為癌癥個性化治療提供更多的遺傳信息依據(jù)，也會成為醫(yī)院疾病診治的有效媒介。